[Каменные дорожки, (извилистые линии которых символизируют поток энергии), приобретают особое значение в японском саду].
Запятая 1 ставится перед придаточным определительным, которое относится к слову дорожки: дорожки (какие?) извилистые линии которых символизируют поток энергии. Придаточная часть присоединяется союзным словом КОТОРЫХ.
Запятая 2 не ставится. Союзное слово КОТОРЫХ находится не в начале придаточной части: она начинается со слов извилистые линии. Поэтому запятая ставится на границе главной и придаточной частей — в позиции 1, а не непосредственно перед которых.
Запятая 3 не ставится: сочетание линии которых входит в состав придаточного предложения. Грамматическая основа придаточной части — линии символизируют, а союзное слово которых является определением при слове линии.
Запятая 4 ставится, потому что здесь заканчивается придаточное определительное извилистые линии которых символизируют поток энергии и продолжается главная часть: каменные дорожки приобретают особое значение в японском саду.