[Учёные отмечают положительную роль конфликтов], (эффективное управление которыми позволяет учесть интересы всех сторон).
Запятая 1 ставится перед придаточным определительным, которое относится к слову конфликтов: конфликтов (каких?) эффективное управление которыми позволяет учесть интересы всех сторон. Придаточная часть присоединяется союзным словом КОТОРЫМИ.
Запятая 2 не ставится. Союзное слово КОТОРЫМИ находится не в начале придаточной части: она начинается сочетанием эффективное управление. Поэтому граница главной и придаточной частей проходит в позиции 1, а не непосредственно перед которыми.
Запятая 3 не ставится: сочетание эффективное управление которыми входит в состав придаточной части. Грамматическая основа — управление позволяет, а союзное слово которыми зависит от существительного управление: управление (чем?) конфликтами.
Запятая 4 не ставится: сочетание учесть интересы всех сторон входит в состав сказуемого позволяет учесть и не требует обособления.