а) После смерти царя Фёдора Алексеевича в 1682 году возник династический кризис. Престол должен был перейти к одному из его братьев — 16-летнему Ивану (от первого брака Алексея Михайловича, за ним стояли Милославские) или 10-летнему Петру (от второго брака, за ним — Нарышкины). Боярская дума и патриарх Иоаким склонились к кандидатуре Петра, так как Ивана считали болезненным и предполагали, что он скоро умрёт, а Пётр выглядел более «перспективным» вариантом. Для Милославских такой поворот означал утрату влияния: от того, кто станет царём, зависело, какой аристократический клан займёт ключевые позиции при дворе. Этим и воспользовались: сторонники Милославских (в том числе царевна Софья) стали сеять среди стрельцов слухи, что при Нарышкиных их ждут ещё большие притеснения;
б) недовольство в стрелецком войске назревало ещё в царствование Фёдора Алексеевича. После создания полков «нового строя» отношение власти к стрельцам изменилось: их всё чаще рассматривали не как элитную военную силу, а как городскую полицию, привлекали к хозяйственным работам. Одновременно казна была пуста, и жалование выплачивали с большими задержками. Старшие командиры злоупотребляли положением: удерживали часть стрелецкого жалованья в свою пользу. Ещё до 1682 года стрельцы подавали челобитные с жалобами, но их перенаправили в Стрелецкий приказ, где жалобщиков за нарушение дисциплины даже наказали — это усилило брожение;
в) в результате бунта сложилась особая модель власти. Земский собор утвердил соправление двух царевичей: Ивана V провозгласили старшим царём, а Петра — младшим. Поскольку оба были малолетними, регентом при них стала царевна Софья Алексеевна. Фактически именно она сосредоточила в своих руках управление государством на последующие семь лет (до 1689 года). Позже, когда повзрослевший Пётр I отстранил Софью от власти, это во многом объяснялось и памятью о событиях 1682 года.